آتئیست‌ها شبهه کرده‌اند که غیرممكن است مردی بتواند با زنان و كنیزان بسیاری هم‌خوابگی داشته باشد و پیامبر خدا باشد! در این دلیل، مفهوم زندگی و ازدواج در ارضای تمایلات جنسی منحصر شده، در حالی که با بررسی تاریخ، مشخص می‌شود که ازدواج‌های پیامبر(ص) از روی مصلحت سیاسی، اجتماعی و فرهنگی بود و کیفیت ازدواج‌ها به گونه‌ای بود که نشانی از هوسرانی در آن نیست.

آتئیست‌ها شبهه کرده‌اند که غیرممكن است مردی بتواند برای تأمین نیاز جامعه مذهبی و سیاسی خود، دست به غارت كاروان‌های تجاری بزند و پیامبر خدا باشد! در پاسخ می‌گوییم منظور یکی از جنگ‌های پیامبر(ص) به نام بدر بوده که واقعیت آن توسط شبهه کننده دیده نشده است.

شیعه‌هراسی یعنی ایجاد خوف و هراس از شیعه، توسط قدرت‌های استعمارگر غرب و بسیاری از کشورهای عربی، به منظور ایجاد تفرقه و محدودسازی فعالیت شیعیان؛ علل هراس غرب و صهیونیسم جهانی از شیعه، نظریه خدامحوری شیعه در مقابل انسان‌ محوری غرب و اندیشه نظام واحد جهانی و پایان تاریخ است که توسط بسیاری از شخصیت‌های علمی جهان مطرح شده است.

مخالفین اسلام با کنار هم گذاردن دو آیه، حکم کرده‌اند که اسلام دین خشونت است؛ زیرا معتقد است که هر که میل به دنیا کند کافر است و کافر را باید کشت. در پاسخ به این استدلال باید گفت که با بیان دو آیه و برداشت نابجا از آن، نمی‌توان به اسلام و ادیان الهی نسبت خشونت داد؛ این برداشت توسط پیامبر(ص) از این آیات نشده است.

خداناباوران به ادیان الهی اتهام خشونت می‌زنند و با آوردن نمونه‌ای مثل توبه قوم بنی‌اسرائیل با کشتن یکیدگر، آن را از پیامبر الهی بعید می‌شمرند؛ در حالی‌که این واقعه و دستور، از جهت منطقی لازم بود و نمی‌توان ادیان الهی را با یک اتفاق، به خشونت متهم کرد. اگر در داستان قوم بنی‌اسرائیل دقت شود، ملاحظه می‌گردد که چقدر حضرت موسی(ع) برای آنان رحمت و گره‌گشا بود.

اشکال کرده‌اند که چون امامت از امام حسن(ع) به امام حسین(ع) رسیده و پس از امام سجاد(ع) به صورت موروثی ادامه پیدا کرده، این سلسله امامت ساختگی است؛ در پاسخ گفته می‌شود که این ایراد، ساختگی بودن را نمی‌رساند؛ بلکه امام بعدی از طرف خداوند مشخص می‌شود و او همان کسی که عصمت و علم لدنی به او عطا شده است. از این‌رو حتی در بین بنی‌هاشم عده‌ای که ادعای امامت کردند، چون علم خدادادی نداشتند مورد پذیرش شیعه واقع نشدند.