جدایی بهائیت و شیعه، از آنجا شروع شد که علی‌محمد شیرازی با استفاده از زمینه‌سازی مسلک شیخیه، در سال 1260ق خودش را نایب خاص یا همان باب امام زمان شیعه معرفی کرد. پرونده این ادعا با احضار علی‌محمد نزد حاکم فارس و خوردن یک سیلی و توبه، بسته شد.