وهابیون شبهه می‌ کنند که اگر ساخت بنا بر قبور جایز است، چرا امیرالمؤمنین (ع) بر هیچ قبری گنبد و بارگاه نساخته است؟ می‌گوییم این عمل در اسلام مشروع است و از آیات قرآن و سیره مستمره مسلمین جواز آن ثابت می‌گردد و امیرالمؤمنین (ع) نیز در زمان حکومتشان دستور به تخریب این بناها ندادند.

یکی از شبهات مخالفین به کتاب اصول کافی این است که می‌گویند، در این کتاب، تاريخ شهادت امام کاظم توسط کسیکه 33 سال قبل از ايشان فوت کرده، نوشته شده است. شبهه کننده ادامه می‌دهد که: يکی از راوی‌هايی که در کتاب اصول کافی بالغ بر 700 روايت نقل کرده است أبوبصير است که تاريخ وفاتش سال 150 بوده است...

وهابیون با ایجاد شبهاتی پیرامون فدک، ادعا می‌کنند، اگر فدک حق مسلم حضرت زهرا (س) بود، چرا امیرالمؤمنین (ع) در باز پس‌گیری آن به حضرت زهرا (س) کمک نکردند. پاسخ این است که قطعاً محدثین اهل سنت از بیان اعتراض و شکایت امیرالمؤمنین (ع) نسبت به فدک و حقوق حضرت زهرا (س) چشم‌پوشی می‌کنند؛ زیرا که بیان این مطلب اثبات غصب خلافت است.

هجوم به خانه حضرت زهرا (س) و آتش زدن آن خانه مطهر، از مسلمات ننگین در تاریخ اسلام است. عمر با آتش زدن خانه سبب شهادت صدیقه طاهره (س) شد. اما مقایسه این عمل شیطانی با افسانه آتش زدن خانه قریش به دست پیامبر (ص) قیاس مع الفارق است. هیچ‌گاه سوزاندن خانه‌های کسانی که امر مستحبی نماز جماعت را کنار گذاشته‌اند، با روح رسالت الهی سازگاری ندارد.

یکی از شبهات مطرح شده از جانب مفتی‌های وهابی، بازی کردن اهل بیت (علیهم‌السلام) در کودکی است و می‌گویند امامان شیعه یکی از نشانه‌های امام را دوری از لعب یا بازی کردن دانسته‌اند. پس شرط امامت را ندارند. در حالی که از منظر اهل بیت (علیهم‌السلام) بازی کردن بی‌فائده، رد بر امامت است.

وهابیون با تهمت و ادعای باطل، قصد دارند تا قتل عثمان را متوجه یاران امیرالمؤمنین علی (علیه‌السلام) کنند. آنان با ادعای دروغ قائل هستند، عده‌ای شورشی و نومسلمان، قاتل عثمان بودند. در حالیکه در منابع معتبر اهل سنت از نقش بعضی همسران رسول خدا (صلی‌الله‌علیه‌وآله) و بعضی از صحابه در این واقعه یاد شده است.