فرقه صوفیه سلطان علیشاهی به انحرافاتی در دین، دچار شده است که نتیجه افراط و تفریطی است که آن‌ها و صوفیان نخستین به آن مبتلا بوده‌اند. از جمله انحرافات فرقه سلطان علیشاهی که بدعتی جدید در دین اسلام به شمار می‎آید عشریه به جای خمس و زکات و همچنین شریعت گریزی و تجسم صورت مرشد در عبادات است.